最新生物學信息圖表標準發(fā)布
日期:2010-09-21 13:30:27
標準化的圖表,做為一種視覺語言,被廣泛應(yīng)用于多個學科領(lǐng)域。使用標準圖表法傳達復雜信息,表意清晰、易于理解。但在圖表信息占據(jù)重要地位的生物學領(lǐng)域,卻一直沒有統(tǒng)一的標準圖表描述所有的生物化學反應(yīng)、路徑和網(wǎng)絡(luò)。
2005年,各國的研究人員開始努力開發(fā)一種專門用于分子和系統(tǒng)生物學研究的新圖表標準,即SBGN項目。該項目由日本東京系統(tǒng)生物學研究所的北野宏明發(fā)起,英國辛克斯頓歐洲生物信息學研究所的尼古拉斯·勒·諾瓦克和美國加州理工學院的邁克爾·胡克負責協(xié)調(diào)。研究團隊則包括生物化學家、模型制作人員和計算機科學家。
勒·諾瓦克指出,在基因組學時代,特別是高通量技術(shù)出現(xiàn)之后,生物學數(shù)據(jù)的規(guī)模總量有了大幅度增長,SBGN會使研究人員更容易了解彼此的模型,更有效地分享數(shù)據(jù)。它將使眾多的系統(tǒng)生物學家從中受益,無論他們研究的重點是生化進程中的哪個環(huán)節(jié)。
為了確保新圖表不會變得過于龐大、復雜,研究人員定義了三種不同類型的圖解,互相補充,描述分子過程、實體關(guān)系和生化活動中的各個環(huán)節(jié)。報道稱,SBGN十分簡單,有眾多研究團體的廣泛參與,相信這種表示法將會迅速得到廣泛的應(yīng)用。
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