如何分析RNA pulldown實驗的結(jié)果？
日期：2025-05-13 10:39:45
定性分析：通過 Western blot 檢測，可以確定已知蛋白質(zhì)是否與目標 RNA 相互作用。將洗脫得到的蛋白質(zhì)樣品進行 SDS - PAGE 電泳，然后轉(zhuǎn)膜，用特異性抗體進行檢測。如果在相應(yīng)的分子量位置出現(xiàn)條帶，說明該蛋白質(zhì)與目標 RNA 有相互作用。
定量分析：可以通過灰度值分析等方法對 Western blot 結(jié)果進行半定量分析，比較不同條件下蛋白質(zhì)與 RNA 相互作用的強弱。此外，還可以使用酶聯(lián)免疫吸附試驗（ELISA）等方法進行定量分析，若采用帶有熒光標記的 RNA 探針，也可通過熒光強度來定量分析 RNA - 蛋白質(zhì)的相互作用。
質(zhì)譜分析：對于篩選未知蛋白質(zhì)與 RNA 的相互作用，質(zhì)譜分析是常用的方法。將洗脫得到的蛋白質(zhì)樣品進行質(zhì)譜分析，通過數(shù)據(jù)庫比對，可以鑒定出與目標 RNA 相互作用的蛋白質(zhì)種類和相對含量。
